104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1069 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 270 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  55.93 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  57.56 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  50.55 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  47.23 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  46.47 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  40.88 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  40.88 
 
 		 274 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.75 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  39.33 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  39.48 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.15 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  37.2 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  36.9 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  37.69 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  35.08 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  38.81 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  37.9 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  37.86 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.58 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.81 
 
 		 443 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.81 
 
 		 443 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.81 
 
 		 443 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  39.76 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  36.78 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  37.6 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.23 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  38.27 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.53 
 
 		 448 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.46 
 
 		 445 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  38.27 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.2 
 
 		 445 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  36.53 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.87 
 
 		 446 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.04 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.74 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.71 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.27 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21430  ATP synthase, F1 delta subunit  27.16 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 		 178 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 		 178 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 180 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  30.54 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  37.68 
 
 		 217 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  35.37 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  31.07 
 
 		 177 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 178 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.33 
 
 		 177 aa  48.9  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 186 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  34.29 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.66 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.93 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.61 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  37.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.24 
 
 		 178 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.16 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  37.84 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 		 179 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.24 
 
 		 186 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.46 
 
 		 179 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  34.88 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.91 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  34.88 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  34.88 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  28.12 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  34.18 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.38 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.38 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.99 
 
 		 186 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.39 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.17 
 
 		 177 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 183 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.89 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  36.76 
 
 		 176 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.73 
 
 		 177 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  38.57 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 		 179 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  21.89 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 		 179 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 		 179 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 		 177 aa  42.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 		 179 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  30.39 
 
 		 178 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 		 179 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>