More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0188 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0188  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
184 aa  348  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  55.73 
 
 
144 aa  120  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 
138 aa  79  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  46.73 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  44.09 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
151 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
151 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
151 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  37.38 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  36.44 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  30.88 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
411 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 
163 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
143 aa  61.6  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 
161 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
139 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  39.29 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0436  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
103 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0742867  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  50.88 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
164 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
219 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
200 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
145 aa  58.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
145 aa  58.2  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
148 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
162 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  43.12 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
150 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  33.06 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
148 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
142 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
148 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
162 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
141 aa  55.1  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
145 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
138 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  34.43 
 
 
154 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 
140 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 
139 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  40.21 
 
 
147 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2552  MarR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33352  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  35.51 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  41.57 
 
 
137 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 
138 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0190752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>