More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1938 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1938  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
377 aa  757    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1719  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.86 
 
 
374 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000748788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  39.71 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.65 
 
 
502 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  39.93 
 
 
511 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  37.89 
 
 
502 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  37.89 
 
 
502 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  37.89 
 
 
502 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  37.89 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  37.89 
 
 
485 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  37.89 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  33.95 
 
 
395 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  37.89 
 
 
485 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  37.89 
 
 
461 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.89 
 
 
477 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.89 
 
 
477 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  38.55 
 
 
498 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  38.55 
 
 
498 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  38.55 
 
 
498 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  38.55 
 
 
500 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  37.23 
 
 
507 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  38.58 
 
 
505 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  40.88 
 
 
473 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.18 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  38.95 
 
 
499 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  39.78 
 
 
494 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  38.95 
 
 
499 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.14 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  39.78 
 
 
493 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  39.78 
 
 
493 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  39.78 
 
 
493 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.74 
 
 
401 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  39.03 
 
 
494 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40.82 
 
 
473 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  39.03 
 
 
494 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  39.03 
 
 
494 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  38.06 
 
 
495 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  33.43 
 
 
443 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  37.83 
 
 
487 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  38.36 
 
 
379 aa  179  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  39.85 
 
 
498 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.41 
 
 
474 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.78 
 
 
474 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  40 
 
 
504 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  36.93 
 
 
503 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  37.26 
 
 
409 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  37.69 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  37.69 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  37.69 
 
 
483 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  37.69 
 
 
495 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  37.69 
 
 
495 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  37.69 
 
 
495 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  37.69 
 
 
495 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  32.82 
 
 
413 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  41.75 
 
 
419 aa  176  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  36.93 
 
 
503 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.31 
 
 
509 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  38.29 
 
 
489 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  36.69 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  34.72 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.79 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  40.22 
 
 
511 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  36.69 
 
 
492 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  37.83 
 
 
491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  39.03 
 
 
504 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  36.8 
 
 
488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  37.83 
 
 
476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  37.83 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  37.45 
 
 
493 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  39.59 
 
 
498 aa  173  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  39.78 
 
 
514 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  37.5 
 
 
516 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  38.29 
 
 
503 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  35.89 
 
 
505 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  35.53 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  34.64 
 
 
500 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.29 
 
 
464 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  35.53 
 
 
451 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  36.7 
 
 
493 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  38.89 
 
 
528 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.66 
 
 
479 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.29 
 
 
492 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  39.78 
 
 
514 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  36.17 
 
 
369 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.29 
 
 
477 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  33.78 
 
 
393 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  38.15 
 
 
380 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.38 
 
 
505 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  32.44 
 
 
396 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  37.82 
 
 
487 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  35.96 
 
 
395 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  34.41 
 
 
490 aa  169  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  36.53 
 
 
469 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  37.08 
 
 
501 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  36.06 
 
 
487 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  32.65 
 
 
453 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  37.92 
 
 
477 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.03 
 
 
457 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  39.03 
 
 
479 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  38.66 
 
 
481 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>