78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4087 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  100 
 
 		 514 aa  1016    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  57.92 
 
 		 502 aa  588  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  58.85 
 
 		 551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  58.85 
 
 		 551 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  58.65 
 
 		 551 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 531 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  58.65 
 
 		 551 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  58.57 
 
 		 531 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  61.23 
 
 		 524 aa  568  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  58.37 
 
 		 531 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  56.76 
 
 		 530 aa  569  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  59 
 
 		 518 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  56.53 
 
 		 519 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  57.14 
 
 		 529 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  56.42 
 
 		 551 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  56.54 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  54.22 
 
 		 507 aa  546  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  53.71 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  56.34 
 
 		 510 aa  540  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  54.31 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  55.73 
 
 		 495 aa  492  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  53.15 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 500 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  38.63 
 
 		 493 aa  332  7.000000000000001e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 		 509 aa  329  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  53.71 
 
 		 457 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  58.6 
 
 		 448 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  48.9 
 
 		 498 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  31.24 
 
 		 450 aa  211  4e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  30.87 
 
 		 450 aa  210  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  30.49 
 
 		 454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  44 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  28.48 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  46.96 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  42.67 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  42.29 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  43.19 
 
 		 443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  37.67 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  30.13 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 		 674 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  32 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.34 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 416 aa  51.2  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  26.32 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  22.92 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  27.93 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  33.33 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 486 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  26.92 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  23.83 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.34 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.34 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.34 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.34 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.34 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.32 
 
 		 472 aa  43.9  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 429 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 405 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  29.35 
 
 		 437 aa  43.5  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 493 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>