89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2455 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  100 
 
 
162 aa  315  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  51.95 
 
 
155 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
154 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  41.67 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 
155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
155 aa  127  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
153 aa  123  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 
154 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  44.83 
 
 
166 aa  121  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  48.39 
 
 
154 aa  120  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
156 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
164 aa  120  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  43.79 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 
160 aa  114  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 
174 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
163 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 
166 aa  107  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  43.57 
 
 
154 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
324 aa  102  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
153 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
154 aa  84.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  34.62 
 
 
142 aa  47.4  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
324 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
140 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  25.81 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
164 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  37.1 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  36.76 
 
 
524 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  25.81 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  39.34 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  30.69 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
408 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5402  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
151 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  30.69 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 
144 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
153 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
165 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  30 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  70 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
229 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
303 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
167 aa  41.2  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  25.81 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0080  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
195 aa  40.8  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 
305 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  41.67 
 
 
188 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  60 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 
300 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  56.67 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0014  ADP-ribose diphosphatase NudE  64.29 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 
151 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>