More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1991 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 69 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1992  XRE family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.979113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  47.69 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  50 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0734  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 224 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.88 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1986  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  49.09 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 252 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4331  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  38.98 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  35.38 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2408  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0754748  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 191 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  50 
 
 		 196 aa  50.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 390 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  35.38 
 
 		 306 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 248 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  39.06 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2399  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  39.06 
 
 		 328 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  45 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40.62 
 
 		 342 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 474 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 72 aa  47.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 383 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 256 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3680  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  48.33 
 
 		 414 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  45.61 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  45.61 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2264  conjugal transfer protein TrbA  37.7 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000287063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  31.82 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  44.62 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  42.37 
 
 		 316 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  34.92 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>