More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1395 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1395  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  598  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  70.17 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  63.67 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 305 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  64.78 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 319 aa  361  7.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 305 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  61.26 
 
 		 305 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  61.26 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0402  AraC family transcriptional regulator  61.2 
 
 		 303 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  57.48 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  54.7 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0389  helix-turn-helix domain-containing protein  51.37 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.813465  normal  0.450006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  52.53 
 
 		 301 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1040  transcriptional regulator, AraC family  55.93 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  46.62 
 
 		 302 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1013  helix-turn-helix domain-containing protein  44.48 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1065  AraC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1039  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00683379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1055  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.300458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  40.36 
 
 		 356 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34.77 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 320 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  34.32 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 348 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  35.04 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.84 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.12 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 		 327 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.43 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 334 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2609  AraC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.263375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 349 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  34.22 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 318 aa  118  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  32.48 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  35.02 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  37.78 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4365  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.822927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.49 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4841  transcriptional regulator, AraC family  38.33 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.579562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  31.75 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6195  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  41.52 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  31.48 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1639  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470025  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  45.7 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1967  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.83417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>