More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8741 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
372 aa  774    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8768  Luciferase-like monooxygenase  49.73 
 
 
375 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.463122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  34.82 
 
 
415 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  34.07 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  34.07 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  34.07 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  34.35 
 
 
439 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  33.52 
 
 
439 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  34.96 
 
 
364 aa  189  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3594  luciferase family protein  31.32 
 
 
387 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335123  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  30.41 
 
 
379 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  30 
 
 
386 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  31.75 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  28.53 
 
 
383 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  31.44 
 
 
382 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  32.6 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  32.6 
 
 
362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2074  luciferase family protein  30.92 
 
 
377 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  29.95 
 
 
402 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  29.44 
 
 
353 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  28.97 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  29.06 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  28.22 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  29.86 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  36.71 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  28.03 
 
 
371 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  29.95 
 
 
347 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.7 
 
 
352 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  29.23 
 
 
345 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  27.91 
 
 
347 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  28.53 
 
 
380 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4909  luciferase-like  25.82 
 
 
384 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3254  luciferase family protein  25.82 
 
 
384 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  26.42 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  25.98 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  29.01 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6510  luciferase family protein  25.82 
 
 
384 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  25.47 
 
 
362 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.08 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  29.92 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  28.46 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  29.92 
 
 
346 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  29.95 
 
 
346 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.88 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  27.91 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  27.95 
 
 
362 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  27.47 
 
 
352 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  27.84 
 
 
347 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  33.64 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  25.94 
 
 
348 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  29.78 
 
 
327 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  28.25 
 
 
330 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  25.37 
 
 
342 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0203  luciferase family protein  27.44 
 
 
362 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444678  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  26.42 
 
 
346 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  26.98 
 
 
336 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  26.03 
 
 
346 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 
328 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  32.24 
 
 
352 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28 
 
 
348 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  30.05 
 
 
363 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  32.98 
 
 
376 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  27.09 
 
 
334 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  25.62 
 
 
355 aa  99.4  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  30.26 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  29.68 
 
 
365 aa  99.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  27.92 
 
 
341 aa  99.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  26.56 
 
 
346 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  33.85 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  28.3 
 
 
345 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1925  luciferase family protein  28.53 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32143  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  30.93 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  32.81 
 
 
321 aa  96.3  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  32.81 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1646  luciferase family protein  26.13 
 
 
405 aa  95.5  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2939  luciferase-like  28.9 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0140506  hitchhiker  0.0000735163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  25.89 
 
 
345 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  27.78 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  25.14 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  26.48 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4429  luciferase family protein  31.84 
 
 
388 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  27.41 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  25.89 
 
 
355 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  28.14 
 
 
334 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7675  putative alkanal monooxygenase (FMN-linked) (luciferase-related)  24.18 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  30.17 
 
 
339 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  26.87 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  23.99 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7561  putative luciferase-like monooxygenase  26.12 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  26.29 
 
 
378 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  24.73 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  27.91 
 
 
316 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  25.35 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4155  luciferase-like  23.42 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.455198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  27.23 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  30.7 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2267  Luciferase-like, subgroup  28.97 
 
 
391 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  28.34 
 
 
345 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3539  luciferase-like  26.38 
 
 
338 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>