119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8725 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 461 aa  897    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  41.03 
 
 		 468 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  41.02 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  41.5 
 
 		 448 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  36.08 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  32.93 
 
 		 511 aa  180  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  35.6 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  33.6 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  31.79 
 
 		 467 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  36.27 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  32.53 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  31.65 
 
 		 529 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  33.65 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  30.07 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  30 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  34.19 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  31.3 
 
 		 555 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  30.6 
 
 		 634 aa  151  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  35.1 
 
 		 531 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  32.79 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  32.79 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  30.51 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  31.34 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.38 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1842  hypothetical protein  27.62 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1561  hypothetical protein  26.78 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0768  protein of unknown function DUF1212  25.3 
 
 		 253 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000933244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  26.25 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1059  protein of unknown function DUF1212  22.59 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.22587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  26.9 
 
 		 637 aa  67  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.48 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0712  hypothetical protein  22.89 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  25.94 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1712  protein of unknown function DUF1212  26.91 
 
 		 247 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  25.67 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  25.67 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  25.67 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.08 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  25.27 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  25.36 
 
 		 158 aa  62.4  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  24.69 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  24.73 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0412  hypothetical protein  27.42 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  23.36 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  25.91 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  25.2 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  25.13 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  23.87 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  27.75 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.66 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  25.1 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  24.7 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  25.33 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  25.33 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  25.33 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  24.39 
 
 		 253 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  24.39 
 
 		 253 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  25.87 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3351  hypothetical protein  25.78 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  24.39 
 
 		 253 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0231  hypothetical protein  24.16 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  23.98 
 
 		 253 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0855  protein of unknown function DUF1212  23.02 
 
 		 260 aa  53.9  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.570744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  31.5 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.41 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1504  hypothetical protein  21.99 
 
 		 251 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.170205  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0234  hypothetical protein  23.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  23.17 
 
 		 253 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  22.89 
 
 		 251 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  26.92 
 
 		 252 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2893  hypothetical protein  24.43 
 
 		 269 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.135065  normal  0.152358 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0769  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000612682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0786  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  50.1  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0287191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  25.7 
 
 		 253 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  27.27 
 
 		 573 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  23.24 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0854  membrane spanning protein  30.68 
 
 		 142 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.607256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0301  hypothetical protein  25.91 
 
 		 251 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.345177  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  24.22 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  24.22 
 
 		 164 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  24.8 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  24.37 
 
 		 148 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  32.28 
 
 		 159 aa  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  22.03 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  25.31 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1171  hypothetical protein  21.78 
 
 		 408 aa  47.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  22.48 
 
 		 258 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  29.55 
 
 		 154 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.21 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  24.31 
 
 		 163 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0277  hypothetical protein  23.77 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  22.4 
 
 		 253 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  22.58 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  32.22 
 
 		 157 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  22.22 
 
 		 303 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  28.71 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  24.38 
 
 		 289 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  22.22 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>