193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4146 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4146  Recombinase  100 
 
 		 457 aa  922    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  46.38 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2373  recombinase  32.35 
 
 		 497 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  31.82 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  31.82 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  33.11 
 
 		 465 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0393  recombinase  28.15 
 
 		 522 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0615  Resolvase domain protein  30.43 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1152  Resolvase domain protein  29.03 
 
 		 460 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3518  recombinase  33.56 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3591  recombinase  33.14 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07990  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.43 
 
 		 529 aa  92.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  29.66 
 
 		 488 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1234  Resolvase domain protein  29.8 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.811381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  24.7 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3568  Resolvase domain protein  29.51 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4166  recombinase  30.77 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4124  recombinase  28.21 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  28.06 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  33.48 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3816  recombinase  29.93 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3890  recombinase  29.93 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4299  recombinase  29.93 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347806  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2721  recombinase  27.27 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.79843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  29.73 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.09 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.58 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6293  recombinase  27.34 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  28.96 
 
 		 534 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.32 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  29.29 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  28.62 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  28.62 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  28.62 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.73 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  21.92 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  21.92 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  21.92 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.67 
 
 		 500 aa  70.1  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  25.68 
 
 		 460 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  31.07 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  25.25 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  27.41 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2519  Resolvase domain protein  27.62 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.55 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.1 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  28.98 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  27.61 
 
 		 534 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2440  Resolvase domain protein  24.52 
 
 		 539 aa  66.6  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  22.8 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  24.07 
 
 		 272 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2051  resolvase domain-containing protein  27.74 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  26.51 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  26.6 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  25.15 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4086  hypothetical protein  26.29 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03270  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  29.09 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.16 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  28.34 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.03 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  22.19 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.02 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  26.98 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  24.89 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.1 
 
 		 563 aa  59.7  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  24.05 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25.25 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  24.05 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.46 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.49 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  41.05 
 
 		 546 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1526  Resolvase domain protein  23.15 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00555834  hitchhiker  0.00000415828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  26.56 
 
 		 540 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  27.84 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  25.32 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  45.21 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  22.88 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  33.92 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4587  DNA recombinase, putative  23.44 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20310  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.42 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0744834  normal  0.198251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1974  Resolvase domain protein  25.7 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.85 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06210  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  28.77 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20360  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  23.58 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872003  normal  0.144817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  28.28 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.4 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  32.32 
 
 		 509 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  23.63 
 
 		 523 aa  57  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  24.9 
 
 		 544 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  35.53 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  24.32 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  26.94 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  26.38 
 
 		 462 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2551  recombinase  25.11 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4207  Recombinase  24.93 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0141412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.65 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>