More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01320 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  47.8 
 
 		 1092 aa  665    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  100 
 
 		 1001 aa  2045    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  43.52 
 
 		 764 aa  584  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  34.36 
 
 		 942 aa  263  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  30.65 
 
 		 498 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  29.45 
 
 		 892 aa  137  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  28.69 
 
 		 421 aa  127  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  32.2 
 
 		 385 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  28.3 
 
 		 497 aa  115  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  26.83 
 
 		 422 aa  114  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  29.3 
 
 		 454 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  28.4 
 
 		 642 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  27.99 
 
 		 423 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  26.36 
 
 		 413 aa  112  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  26.58 
 
 		 422 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  27.99 
 
 		 497 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  28.42 
 
 		 481 aa  109  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  28.75 
 
 		 500 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  28.62 
 
 		 484 aa  105  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  28.77 
 
 		 482 aa  104  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  30.17 
 
 		 474 aa  104  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  26.42 
 
 		 507 aa  103  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  23.75 
 
 		 1015 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  28.77 
 
 		 484 aa  103  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  23.76 
 
 		 492 aa  102  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  29.74 
 
 		 437 aa  99.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  25.28 
 
 		 497 aa  100  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_8086  predicted protein  40.91 
 
 		 114 aa  99.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  27.68 
 
 		 467 aa  99  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  25.83 
 
 		 483 aa  97.8  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  24.91 
 
 		 514 aa  97.8  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  28.31 
 
 		 476 aa  96.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  25.07 
 
 		 451 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  28.45 
 
 		 418 aa  89.7  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  26.16 
 
 		 405 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  25.86 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  26.1 
 
 		 725 aa  76.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2539  DNA ligase, NAD-dependent  40.86 
 
 		 696 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15652  predicted protein  23.51 
 
 		 894 aa  76.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  51.35 
 
 		 707 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  26.42 
 
 		 235 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2085  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  45.16 
 
 		 672 aa  75.5  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3645  DNA ligase, NAD-dependent  45.88 
 
 		 692 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  25.63 
 
 		 1223 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  46.08 
 
 		 681 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2628  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.15 
 
 		 693 aa  71.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.533906  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  28.63 
 
 		 289 aa  71.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06694  Chromosome transmission fidelity protein 18 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C1D3]  24.83 
 
 		 993 aa  70.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0563098 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  29.11 
 
 		 334 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  42.53 
 
 		 712 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  27.9 
 
 		 326 aa  70.1  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  42.7 
 
 		 673 aa  68.9  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.88 
 
 		 679 aa  68.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  27.12 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  43.75 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.58 
 
 		 697 aa  68.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  25.61 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  50.68 
 
 		 683 aa  68.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  36.36 
 
 		 666 aa  67.8  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  42.17 
 
 		 688 aa  67.4  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  42.17 
 
 		 688 aa  67.4  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  48.65 
 
 		 673 aa  67.4  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  37.63 
 
 		 662 aa  67.8  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  48.65 
 
 		 670 aa  67.4  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  40.4 
 
 		 726 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  26.32 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  23.68 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1084  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.03 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.419808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  39.76 
 
 		 700 aa  65.1  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  47.95 
 
 		 675 aa  65.1  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  44.09 
 
 		 683 aa  65.1  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  42 
 
 		 711 aa  65.1  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  43.04 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  25.99 
 
 		 398 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  41.46 
 
 		 670 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 696 aa  63.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  43.62 
 
 		 688 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  24.47 
 
 		 341 aa  63.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  38.24 
 
 		 664 aa  63.9  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 		 704 aa  63.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.16 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.05 
 
 		 718 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  39.83 
 
 		 732 aa  63.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 688 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  24.14 
 
 		 349 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  46.75 
 
 		 694 aa  63.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  38.16 
 
 		 670 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  40.78 
 
 		 920 aa  63.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  46.48 
 
 		 663 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1066  DNA ligase, NAD-dependent  42.31 
 
 		 709 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  48.68 
 
 		 677 aa  62.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.78 
 
 		 691 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  45.07 
 
 		 690 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 676 aa  62  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  40 
 
 		 749 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  24.29 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  45.07 
 
 		 690 aa  62  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  40.43 
 
 		 691 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>