36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43936 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  100 
 
 		 1223 aa  2544    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15652  predicted protein  28.52 
 
 		 894 aa  84  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  25.63 
 
 		 1001 aa  73.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10917  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 1127 aa  67.8  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  29.05 
 
 		 418 aa  63.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01900  conserved expressed protein  24.92 
 
 		 724 aa  62.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550521  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  27.31 
 
 		 1015 aa  61.6  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  25.24 
 
 		 422 aa  60.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  24.43 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  28.8 
 
 		 764 aa  59.3  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  24.88 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  26.67 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  25.59 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  22.68 
 
 		 1092 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  24.52 
 
 		 482 aa  57.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  24.04 
 
 		 484 aa  56.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  24.76 
 
 		 497 aa  56.2  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  26.88 
 
 		 443 aa  55.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  24.02 
 
 		 492 aa  53.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  25.24 
 
 		 514 aa  53.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  24.09 
 
 		 497 aa  53.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  23.81 
 
 		 423 aa  52.4  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  23.8 
 
 		 892 aa  52  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  22.77 
 
 		 422 aa  51.6  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  29.22 
 
 		 437 aa  50.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  23.64 
 
 		 942 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  25 
 
 		 507 aa  49.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  23.65 
 
 		 500 aa  48.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  26.67 
 
 		 476 aa  47.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  25.29 
 
 		 497 aa  47.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  33.85 
 
 		 235 aa  47  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  27.08 
 
 		 405 aa  46.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  24.12 
 
 		 403 aa  46.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  25 
 
 		 498 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  23.44 
 
 		 642 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  25.67 
 
 		 281 aa  45.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>