More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03550 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  71.96 
 
 		 443 aa  660    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  100 
 
 		 450 aa  917    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  73.35 
 
 		 446 aa  682    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  71.33 
 
 		 429 aa  629  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  66.44 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  55.95 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  55.16 
 
 		 389 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  49.22 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  53.82 
 
 		 407 aa  332  9e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  50 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  51.3 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  52.46 
 
 		 407 aa  329  7e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  53.55 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  52.46 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  49.03 
 
 		 421 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  52.13 
 
 		 407 aa  326  6e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  44.5 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  50.65 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  51.82 
 
 		 407 aa  323  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  56.58 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  53.99 
 
 		 403 aa  318  9e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  49.36 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  49.03 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  48.75 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  47.35 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  52.88 
 
 		 405 aa  315  7e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  49.84 
 
 		 422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 412 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  52.4 
 
 		 410 aa  312  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  49.33 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  53.68 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  49.35 
 
 		 416 aa  310  5e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  49.66 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  52.52 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  48.53 
 
 		 412 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  45.48 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  48.06 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  50.34 
 
 		 410 aa  303  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  48.99 
 
 		 408 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  45.79 
 
 		 460 aa  302  8.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  49.03 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  48.72 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  51.54 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  51.03 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  48.94 
 
 		 413 aa  296  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  51.28 
 
 		 415 aa  296  7e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  51.76 
 
 		 404 aa  295  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  48.54 
 
 		 425 aa  294  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  46.77 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  49.32 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  47.9 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  49.66 
 
 		 429 aa  293  5e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  50.72 
 
 		 405 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  49.31 
 
 		 464 aa  292  9e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  49.16 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  50 
 
 		 405 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  50 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  46.51 
 
 		 407 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  51.97 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  47.35 
 
 		 389 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  50.54 
 
 		 410 aa  279  8e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  48.69 
 
 		 417 aa  274  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  49.63 
 
 		 414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  48.8 
 
 		 739 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  50.22 
 
 		 768 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  49.78 
 
 		 769 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  45.82 
 
 		 681 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.61 
 
 		 639 aa  229  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.36 
 
 		 651 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  45.28 
 
 		 641 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  46.03 
 
 		 656 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.88 
 
 		 620 aa  226  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.4 
 
 		 650 aa  226  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.28 
 
 		 659 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  42.04 
 
 		 699 aa  224  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 		 630 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  48.77 
 
 		 776 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.66 
 
 		 651 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.92 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.61 
 
 		 630 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  43.28 
 
 		 643 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  44.03 
 
 		 644 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.03 
 
 		 647 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 644 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.66 
 
 		 654 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 644 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.37 
 
 		 679 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  43.28 
 
 		 647 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  44.03 
 
 		 644 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  44.03 
 
 		 647 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  43.28 
 
 		 644 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>