More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0890 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  100 
 
 
344 aa  697    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  48.36 
 
 
354 aa  360  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  48.8 
 
 
354 aa  358  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  47.94 
 
 
354 aa  358  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  45.91 
 
 
349 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  47.34 
 
 
350 aa  341  9e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  46.31 
 
 
351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  46.15 
 
 
350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  46.46 
 
 
350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  46.15 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  46.15 
 
 
350 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  45.45 
 
 
353 aa  325  7e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  30.37 
 
 
361 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  30.37 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  30.14 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  28 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.54 
 
 
360 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  31.08 
 
 
374 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.47 
 
 
362 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  26.63 
 
 
348 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.66 
 
 
362 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  28.66 
 
 
378 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  30 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  30.41 
 
 
358 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.56 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.89 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.98 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
375 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  29.46 
 
 
353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  27.12 
 
 
345 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  29.08 
 
 
378 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.69 
 
 
374 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  26.99 
 
 
348 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.04 
 
 
315 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.97 
 
 
369 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.05 
 
 
315 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  27.96 
 
 
376 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.43 
 
 
360 aa  106  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  25.55 
 
 
354 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.53 
 
 
363 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  27.32 
 
 
375 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.25 
 
 
360 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  28.27 
 
 
366 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
341 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  27.75 
 
 
401 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  27.33 
 
 
403 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
361 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  24.92 
 
 
362 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.88 
 
 
354 aa  104  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  26.2 
 
 
337 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  29.09 
 
 
409 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  27.52 
 
 
349 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.51 
 
 
375 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  23.88 
 
 
370 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.81 
 
 
366 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.93 
 
 
351 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  27.33 
 
 
348 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  27.03 
 
 
401 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
375 aa  99.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
375 aa  99.4  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.8 
 
 
357 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.98 
 
 
370 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  26.41 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  27.5 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  26.32 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.39 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.87 
 
 
381 aa  97.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  28.8 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.71 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.66 
 
 
393 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.25 
 
 
351 aa  95.9  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  27.38 
 
 
409 aa  95.9  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  27.36 
 
 
369 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
682 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1701  periplasmic binding protein  29.13 
 
 
365 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.14 
 
 
344 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25.23 
 
 
682 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.45 
 
 
346 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  27.76 
 
 
368 aa  93.6  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  27.09 
 
 
353 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  29.5 
 
 
349 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  28.7 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  24.71 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  24.04 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  25.82 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  26.59 
 
 
372 aa  90.1  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  28.49 
 
 
324 aa  90.1  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  26.89 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
363 aa  89.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  25.43 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  27.09 
 
 
340 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.62 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  23.12 
 
 
327 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  25.6 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  26.29 
 
 
387 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1058  periplasmic binding protein  25.14 
 
 
370 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.530502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>