More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3280 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  607  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  95.13 
 
 
267 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  61.42 
 
 
273 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  60.3 
 
 
278 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  59.55 
 
 
275 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  59.18 
 
 
279 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  58.8 
 
 
275 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  57.3 
 
 
283 aa  322  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  53.31 
 
 
295 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  52.43 
 
 
275 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  55.06 
 
 
275 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  54.68 
 
 
280 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  53.56 
 
 
283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  50.87 
 
 
310 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  52.81 
 
 
282 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  52.81 
 
 
270 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  53.93 
 
 
268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  52.81 
 
 
276 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  55.51 
 
 
267 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  50.56 
 
 
279 aa  298  7e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  52.06 
 
 
277 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  53.44 
 
 
294 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  54.58 
 
 
269 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  51.69 
 
 
279 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  51.31 
 
 
279 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  50.92 
 
 
272 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  49.81 
 
 
280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  49.26 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  51.53 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  51.14 
 
 
292 aa  279  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  48.69 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  46.49 
 
 
282 aa  269  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  48.69 
 
 
270 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  48.69 
 
 
270 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  50 
 
 
280 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  48.15 
 
 
271 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  47.92 
 
 
294 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  44.44 
 
 
272 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  41.73 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  40.46 
 
 
271 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  43.75 
 
 
266 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  41.13 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  38.95 
 
 
288 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  36.19 
 
 
276 aa  176  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  38.67 
 
 
264 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  38.76 
 
 
281 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  36.07 
 
 
291 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  37.98 
 
 
284 aa  168  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  37.27 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  34.08 
 
 
266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  36.68 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  38.52 
 
 
298 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  39.61 
 
 
286 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  34.7 
 
 
282 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  36.43 
 
 
281 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  36.43 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  34.56 
 
 
293 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  33.83 
 
 
285 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  35.34 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  35.91 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  35.41 
 
 
286 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  35.41 
 
 
286 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  34.48 
 
 
367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  34.51 
 
 
286 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  35.02 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  32.44 
 
 
254 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  31.97 
 
 
261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  31.44 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  29.66 
 
 
258 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  33.94 
 
 
264 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  30.3 
 
 
268 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 
289 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  40.12 
 
 
263 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  35.78 
 
 
271 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  27.24 
 
 
260 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  31.84 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.15 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.15 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  30.34 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  25.37 
 
 
261 aa  92.4  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  33.02 
 
 
269 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  33.52 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  34.13 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  34.51 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  27.67 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  28.85 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  32.76 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  35.97 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1884  transglutaminase domain protein  37.07 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00405272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  27.43 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2203  transglutaminase domain protein  37.93 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.424742  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  38.89 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  31.78 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  34.06 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  37.39 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3519  transglutaminase domain-containing protein  30.04 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.317812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>