More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2210 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2210  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5197  transcriptional regulator, GntR family  48.87 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.477284  normal  0.133192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5467  transcriptional regulator, GntR family  49.52 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660908  normal  0.362752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0360  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.200246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5699  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417067  normal  0.240474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4211  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.349011  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0172  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.75763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  26.82 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0481  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  25.45 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0496  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.118787  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.96 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  25.59 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  27.03 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2671  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3236  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  23.15 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  32.85 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  34.34 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2967  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3649  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.078478  normal  0.168934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2081  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3224  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  25.62 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  26.37 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  25.98 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2259  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6111  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  26.73 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6257  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648776  normal  0.0618122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  27.85 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.57 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  27.45 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  26.32 
 
 		 263 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 240 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2254  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.576687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>