More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1907 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  62.03 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  62.03 
 
 		 192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  59.39 
 
 		 198 aa  198  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 174 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4788  MarR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 124 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.421103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.25 
 
 		 139 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  30.71 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  28.87 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.16 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  27.13 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  29.81 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  30.71 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  25 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  28.18 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  27.07 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  27.27 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  26.5 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  25.18 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 144 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0796  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.517671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>