More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5812 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  88.24 
 
 		 187 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  69.02 
 
 		 187 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  68.45 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  68.45 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  68.45 
 
 		 187 aa  254  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  67.39 
 
 		 187 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  65.03 
 
 		 191 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  66.3 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  65.24 
 
 		 187 aa  248  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  60.87 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  63.59 
 
 		 185 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  61.75 
 
 		 188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  59.89 
 
 		 187 aa  220  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  58.2 
 
 		 193 aa  207  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  54.59 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  50 
 
 		 204 aa  171  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  47.09 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  44.5 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  44.5 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  43.81 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  41.81 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  44.97 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  44.97 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  44.97 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  44.97 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  44.97 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  44.97 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  40.84 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  44.97 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  42.62 
 
 		 188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  44.44 
 
 		 188 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  42.49 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  41.97 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  41.76 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  42.78 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  42.78 
 
 		 192 aa  120  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  45.56 
 
 		 190 aa  118  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  44.71 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  35.11 
 
 		 200 aa  104  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  40.72 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  36.61 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  37.58 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.07 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  34.87 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  28.34 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  34.35 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  30.43 
 
 		 221 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  37.41 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  36.36 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1200  isochorismatase family protein  36.6 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.474191  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2266  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5659  isochorismatase hydrolase  36.81 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.616311  normal  0.236437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  32.16 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 		 342 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  32.68 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  29.02 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  35.33 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  49.15 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  32.17 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8036  putative isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2098  isochorismatase family protein  32.67 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  32.17 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  35.84 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  35.42 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  38.6 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3421  isochorismatase hydrolase  30.56 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  31.72 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  35.26 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2494  isochorismatase hydrolase  32.42 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12730  hypothetical protein  31.28 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  32.64 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  31.47 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2188  isochorismatase hydrolase  31.76 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288867  normal  0.048401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0508  isochorismatase family protein  36.3 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3597  isochorismatase family protein  36.3 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1403  isochorismatase hydrolase  29.68 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  26.37 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0670  isochorismatase family protein  36.3 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  35.76 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0966  isochorismatase family protein  36.3 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145103  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1936  isochorismatase family protein  36.3 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3608  isochorismatase family protein  36.3 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>