More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4826 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  100 
 
 		 352 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  93.47 
 
 		 352 aa  627  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  49.48 
 
 		 384 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  54.86 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  54.73 
 
 		 357 aa  305  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  50.14 
 
 		 350 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  50 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  48.27 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 333 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  45.26 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  41.62 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  45.9 
 
 		 398 aa  275  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 346 aa  275  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  47.87 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  44.41 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  43.34 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  45.56 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.71 
 
 		 355 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  44.41 
 
 		 359 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  44.99 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  51.99 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  49.86 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  51.99 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  44.89 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  44.89 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  51.62 
 
 		 349 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  43.5 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  46.73 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  41.5 
 
 		 345 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  49.28 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  47.67 
 
 		 364 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  48.08 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  51.58 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.01 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  47.13 
 
 		 352 aa  245  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  50 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  42.94 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  48.9 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  49.82 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.94 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  41.21 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  49.46 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  52.6 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.5 
 
 		 357 aa  233  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 387 aa  232  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.37 
 
 		 377 aa  232  7.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.33 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  38.51 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  44.71 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.43 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  43.43 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0122  ABC transporter related  39.55 
 
 		 347 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  43.33 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  43.33 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.94 
 
 		 366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  41.21 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  46.34 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  44.6 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  42.17 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  38.55 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  45.58 
 
 		 378 aa  222  8e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  46.43 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  45.24 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  39.41 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 349 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  39.37 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  41.26 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  44 
 
 		 346 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  35.76 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 370 aa  219  7e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  39.89 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 		 356 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  38.17 
 
 		 364 aa  218  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.28 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.21 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.06 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 1057 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  41.09 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  46.85 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  37.75 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  46.28 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.29 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 353 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 		 371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  42.47 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  42.47 
 
 		 349 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  42.47 
 
 		 349 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 353 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  42.47 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.47 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  48 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.18 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>