More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4754 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  85.05 
 
 		 852 aa  1484    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 852 aa  1752    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  62.57 
 
 		 857 aa  1036    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 		 841 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 704 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 826 aa  459  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 701 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.72 
 
 		 699 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 716 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 847 aa  349  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 857 aa  337  7e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 851 aa  336  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  26.92 
 
 		 681 aa  266  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  28.03 
 
 		 686 aa  261  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  26.04 
 
 		 681 aa  258  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  33.81 
 
 		 822 aa  227  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 409 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  32.07 
 
 		 846 aa  187  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  34.64 
 
 		 849 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 1009 aa  183  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 1165 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 1326 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  29.45 
 
 		 2035 aa  171  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 1574 aa  169  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.02 
 
 		 1331 aa  168  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  26.37 
 
 		 420 aa  164  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  26.37 
 
 		 420 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.72 
 
 		 1177 aa  163  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 1193 aa  161  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 1625 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 1622 aa  158  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 1629 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1303 aa  155  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  29.57 
 
 		 861 aa  154  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1611 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 1629 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 1768 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.72 
 
 		 1763 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.42 
 
 		 1550 aa  151  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 1765 aa  150  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 		 1033 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 929 aa  149  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 946 aa  148  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1124 aa  148  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 1767 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 		 1767 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.09 
 
 		 1765 aa  147  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.25 
 
 		 1118 aa  147  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  31.77 
 
 		 979 aa  146  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 1021 aa  146  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  29.38 
 
 		 923 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 916 aa  145  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 1659 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  25.31 
 
 		 1683 aa  144  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 1771 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  28.86 
 
 		 1417 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 		 1267 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  31.75 
 
 		 1346 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 1626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1314 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.12 
 
 		 2213 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1005 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  25.93 
 
 		 420 aa  141  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  31.92 
 
 		 847 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1362 aa  140  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 1202 aa  140  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  28.89 
 
 		 1214 aa  140  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 1016 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 		 1340 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.39 
 
 		 1499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  30.16 
 
 		 647 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 		 1240 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.79 
 
 		 1468 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  30.17 
 
 		 1001 aa  138  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 876 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 		 1767 aa  137  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 1792 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 801 aa  137  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  29.56 
 
 		 1418 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 		 1632 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 		 1166 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.51 
 
 		 1786 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 1784 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 1266 aa  135  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3915  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 839 aa  135  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.87 
 
 		 1782 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 981 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.43 
 
 		 1442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  30.43 
 
 		 1364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 778 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  30.11 
 
 		 1361 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  30.56 
 
 		 977 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 		 1426 aa  130  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  25.79 
 
 		 410 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  27.87 
 
 		 1439 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 1284 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1064 aa  130  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>