More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2180 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 577 aa  1167    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6668  glucose-methanol-choline oxidoreductase  78.22 
 
 		 576 aa  919    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1311  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.4 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4787  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.78 
 
 		 573 aa  591  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.824401  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4733  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.76 
 
 		 568 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6576  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.83 
 
 		 583 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.298955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6155  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.14 
 
 		 559 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.2 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.833385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1504  putative choline dehydrogenase  44.78 
 
 		 591 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228546  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4242  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.17 
 
 		 549 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.79 
 
 		 549 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.79 
 
 		 533 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.45 
 
 		 515 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.64 
 
 		 536 aa  246  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.46 
 
 		 534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.68 
 
 		 539 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.52 
 
 		 536 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 550 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  31.69 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.28 
 
 		 535 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  34.39 
 
 		 548 aa  239  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  35.11 
 
 		 551 aa  239  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.55 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.58 
 
 		 551 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3579  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.54 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000745521  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  30.91 
 
 		 556 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.47 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.43 
 
 		 551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  33 
 
 		 559 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.95 
 
 		 544 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 559 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 576 aa  234  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5337  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.55 
 
 		 600 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.231686 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.1 
 
 		 518 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.44 
 
 		 576 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.47 
 
 		 541 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0882717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  33.39 
 
 		 550 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  34.17 
 
 		 1290 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  34.04 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  31.37 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.82 
 
 		 531 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  34.61 
 
 		 559 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  31.58 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.44 
 
 		 547 aa  230  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 548 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3919  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.36 
 
 		 572 aa  230  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.326511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  32.65 
 
 		 534 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  32.94 
 
 		 557 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2513  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.9 
 
 		 571 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138495  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.01 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  31.76 
 
 		 561 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  31.76 
 
 		 561 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3601  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.08 
 
 		 572 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.41 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  31.76 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  31.76 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.33 
 
 		 574 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6705  choline dehydrogenase  31.93 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  33.11 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0331  GMC oxidoreductase  34 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.61 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.39 
 
 		 530 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5443  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.05 
 
 		 542 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  34.02 
 
 		 551 aa  227  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  33.96 
 
 		 545 aa  227  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  31.14 
 
 		 569 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.1 
 
 		 551 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.19 
 
 		 529 aa  227  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.9 
 
 		 550 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.91 
 
 		 509 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33 
 
 		 551 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.66 
 
 		 551 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.78 
 
 		 540 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.17 
 
 		 542 aa  226  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1426  putative GMC-type oxidoreductase  33.5 
 
 		 557 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1946  choline dehydrogenase  31.48 
 
 		 560 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16390  putative GMC-type oxidoreductase  33 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  33.51 
 
 		 544 aa  224  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  33.39 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  33.39 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  33.39 
 
 		 556 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.19 
 
 		 556 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.56 
 
 		 553 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.14 
 
 		 554 aa  224  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  32.39 
 
 		 565 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  31.28 
 
 		 547 aa  223  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.44 
 
 		 543 aa  223  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3506  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.94 
 
 		 575 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145411  normal  0.0815254 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2148  GMC family oxidoreductase  34.05 
 
 		 613 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.78 
 
 		 550 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.5 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1739  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.28 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3275  GMC family oxidoreductase  34.05 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.183424  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3406  GMC family oxidoreductase  34.05 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0411  GMC family oxidoreductase  34.05 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0228  GMC family oxidoreductase  34.05 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2941  GMC family oxidoreductase  34.05 
 
 		 547 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.44858  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.07 
 
 		 560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.09 
 
 		 609 aa  222  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.32 
 
 		 531 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>