131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0838 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 137 aa  279  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  88.32 
 
 		 160 aa  254  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  84.67 
 
 		 137 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 137 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 151 aa  231  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  83.09 
 
 		 160 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  83.09 
 
 		 137 aa  230  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  83.09 
 
 		 141 aa  229  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  83.09 
 
 		 141 aa  229  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  83.09 
 
 		 141 aa  229  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 152 aa  229  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  81.62 
 
 		 137 aa  229  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  83.21 
 
 		 137 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  80.88 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  80.88 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  80.88 
 
 		 137 aa  227  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  80.15 
 
 		 137 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  63.28 
 
 		 169 aa  170  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  65.32 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  56.62 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  59.54 
 
 		 139 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 144 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  59.52 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  60.98 
 
 		 135 aa  147  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 277 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  45.9 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  38.21 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.290738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 196 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  37.35 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2280  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.421231  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  37.84 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 154 aa  43.5  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  32.22 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 147 aa  42  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 151 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 171 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 150 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>