More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7053 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  763    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  79.1 
 
 		 378 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  78.84 
 
 		 378 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  74.67 
 
 		 385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  66.12 
 
 		 383 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  56.44 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  54.31 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  51.01 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  50.86 
 
 		 371 aa  347  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  49.45 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  51.52 
 
 		 376 aa  345  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  47.12 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  49.87 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 374 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  48.86 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  47.65 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  46.63 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  44.41 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  43.13 
 
 		 365 aa  298  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  48.44 
 
 		 371 aa  295  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  42.16 
 
 		 375 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  40.27 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  28.33 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  27.76 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  26.81 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  27.2 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  27.76 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  27.76 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  28.29 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.91 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  27.48 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  27.48 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.4 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  28.92 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  27.2 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.94 
 
 		 984 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 983 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 389 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.22 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.85 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 386 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 		 373 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  29.06 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.58 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.4 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.54 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.43 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  30.05 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.82 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.68 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.63 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.63 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.48 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.63 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.63 
 
 		 391 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.87 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.87 
 
 		 391 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.99 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  26.54 
 
 		 330 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.38 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 500 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.5 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 500 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 496 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 415 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.49 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 376 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.8 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.03 
 
 		 385 aa  92.8  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>