124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5858 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  100 
 
 
153 aa  307  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  53.96 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  53.96 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  53.24 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  53.24 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  53.24 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  53.24 
 
 
142 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  53.79 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  53.79 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  51.88 
 
 
142 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  48.94 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  53.44 
 
 
142 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  47.55 
 
 
144 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  47.46 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  39.47 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  37.93 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  43.12 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  39.29 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  39.22 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  45.45 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  35 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  37.17 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  50.94 
 
 
136 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  50.94 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  48.98 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  27.94 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  46.55 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  49.09 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  53.06 
 
 
145 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  47.92 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  47.92 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  47.92 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  47.92 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  45.61 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  32.09 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  46.43 
 
 
176 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.07 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  47.92 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.07 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.07 
 
 
164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  49.02 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  42.86 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  44.23 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  44.23 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  28.57 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  28.57 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4120  TadE family protein  43.86 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  29.73 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0801  TadE family protein  51.72 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  48.98 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  32.18 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  30 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  39.66 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  40.91 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  40.43 
 
 
160 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  32.14 
 
 
219 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  37.35 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  40.68 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  30.28 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  32 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  38.1 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  43.14 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  40.68 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  44.9 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  44.07 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  43.1 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  47.73 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  34.29 
 
 
209 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  38.1 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  30.06 
 
 
186 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  30.12 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  44.74 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  47.73 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  47.73 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  43.1 
 
 
722 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4159  TadE family protein  34.56 
 
 
465 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4966  TadE family protein  28.24 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.299323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  46.55 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  29.05 
 
 
162 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  38.78 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  37.04 
 
 
204 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  43.14 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  36.92 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  30.56 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  46.67 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  41.18 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  42.22 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4122  TadE family protein  45.24 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  42.62 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  38.89 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  36.73 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  37.88 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  38.89 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  36.73 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  48.15 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  38.89 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>