49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3935 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  100 
 
 		 142 aa  274  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  99.3 
 
 		 142 aa  273  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  81.69 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  66.9 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  66.9 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  66.9 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  66.9 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  66.9 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  66.9 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  66.9 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  53.79 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  46.15 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  48.18 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  36.3 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  30.91 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  38.98 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  38.84 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  36.45 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  37.04 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  47.27 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  47.27 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  27.12 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  37.38 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  31.72 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  36.67 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  26.28 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  30.61 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  31.34 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  41.51 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  32 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  38 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40.43 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  40 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  37.74 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  35.29 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  29.31 
 
 		 168 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0801  TadE family protein  48.08 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  35.48 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  34.88 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  39.76 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  39.76 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  39.76 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>