48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0644 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  100 
 
 		 176 aa  357  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  56.11 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  55.56 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  53.04 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  55.03 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  55.03 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  54.44 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  53.25 
 
 		 722 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  51.93 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  52.07 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  53.61 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  43.89 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  41.34 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  42.01 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  39.77 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  34.78 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  41.96 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  47.17 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  29.56 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  38.67 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  25.15 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.86 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  34.53 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  31.11 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  36.36 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  39.58 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  39.58 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  39.58 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  46.81 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  31.17 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  35.87 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  39.62 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  44.68 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  46.67 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  48.84 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  37.5 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  39.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  46.43 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  39.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  39.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  43.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  36.96 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  35.56 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  43.4 
 
 		 126 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  35.42 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.34 
 
 		 140 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  34.69 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  36.84 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>