68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0306 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  74.47 
 
 		 189 aa  278  4e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  61.76 
 
 		 181 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  61.63 
 
 		 181 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  60.95 
 
 		 177 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7024  hypothetical protein  68.39 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  46.89 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  48.35 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0800  TadE family protein  39.57 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  39.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0226  TadE family protein  39.16 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  35.33 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4198  TadE family protein  41.21 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4097  TadE-like  33.51 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.660373  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  32.96 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2822  TadE family protein  34.74 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0226  hypothetical protein  30.96 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4183  TadE family protein  31 
 
 		 211 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0364  TadE family protein  33.85 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0502839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4471  TadE family protein  30.93 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360977  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2389  TadE family protein  36.26 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.007335  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3347  TadE family protein  30.85 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6384  TadE family protein  31.35 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.398428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5559  TadE family protein  33.67 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.973311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0867  TadE family protein  32.11 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0542  TadE family protein  32.26 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  29.65 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0931  TadE family protein  28.26 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.837176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3820  TadE family protein  26.92 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0837  hypothetical protein  29.09 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.21812  normal  0.663687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2083  TadE family protein  30.89 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0892  TadE family protein  27.72 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3513  TadE family protein  26.92 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  46.3 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  46 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  46 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2053  hypothetical protein  28.82 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.678498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0400  hypothetical protein  28.82 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  33.78 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  46.94 
 
 		 156 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  28.89 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  45.65 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  42.59 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  42.59 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  22.68 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  24.86 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  36.67 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  32.35 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3898  TadE family protein  25 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  47.83 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  26.55 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  26.47 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0595  TadE-like family protein  29.01 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0055  TadE family protein  37.5 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.258579  normal  0.372833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0264  hypothetical protein  29.01 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000101731  hitchhiker  0.00000909351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  48.08 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  41.82 
 
 		 148 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3201  TadE family protein  26.32 
 
 		 148 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.517577 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  38.6 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  37.5 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  29.46 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>