71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1401 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  100 
 
 		 156 aa  312  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  58.62 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  58.62 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  58.62 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  58.62 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  58.62 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  58.62 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  59.31 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  59.44 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  55.26 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  55 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  56.64 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  55 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  55.92 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  43.79 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  43.79 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.52 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  44.38 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  34.69 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  32.1 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  35.81 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  38.26 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  31.95 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  31.79 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  31.06 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  33.33 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  32.65 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  31.17 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  30.67 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  32.21 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  47.17 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  34.72 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  34.72 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  33.04 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  46.77 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  32.73 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  35.25 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  37.04 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  50 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  46.94 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.03 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  46.67 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  37.68 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  29.93 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  31.86 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  41.07 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  31.5 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  38.6 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  32.88 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  30.28 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  33.93 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  34.43 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  44.44 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  36.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  32.81 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  30.51 
 
 		 138 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  36.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  36.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  35.9 
 
 		 140 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  37.5 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  32.26 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  31.71 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  44.68 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  38.89 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  44.68 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  40.82 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  27.46 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  40.82 
 
 		 179 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>