41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3944 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  100 
 
 
170 aa  350  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  34.76 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1267  TadE family protein  35.37 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.131769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  32.95 
 
 
192 aa  53.9  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  27.78 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  45.1 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  33.33 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  41.1 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  44 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  43.14 
 
 
153 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  43.14 
 
 
153 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  43.14 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  24.82 
 
 
163 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  43.14 
 
 
153 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  36.36 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  37.25 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  42 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  25.15 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  42 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  40 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  42 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  45.83 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  39.68 
 
 
126 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3943  TadE family protein  27.06 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  39.13 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  40 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  41.3 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  39.13 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  25.9 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  44.9 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  35.85 
 
 
135 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4399  TadE family protein  33.33 
 
 
208 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  44.12 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  44.23 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  32.94 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  39.22 
 
 
136 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  55.17 
 
 
204 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  39.22 
 
 
136 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  40 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  33.96 
 
 
163 aa  40.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>