51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7198 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  100 
 
 
177 aa  363  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  94.35 
 
 
177 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  93.79 
 
 
177 aa  344  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  93.79 
 
 
177 aa  344  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  80.79 
 
 
177 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  81.36 
 
 
177 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  71.26 
 
 
180 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  70.69 
 
 
180 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  70.69 
 
 
722 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  71.26 
 
 
168 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  52.07 
 
 
176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  41.57 
 
 
156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  41.9 
 
 
165 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  42.77 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  39.49 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  33.73 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  44.44 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.5 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  41.51 
 
 
160 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  40.18 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  46.15 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  44 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  43.64 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  43.64 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  43.64 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  43.64 
 
 
147 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  45.76 
 
 
145 aa  48.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  34.38 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  50 
 
 
126 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  31.86 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  34.09 
 
 
134 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  38.16 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  45.45 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  40.74 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  46 
 
 
148 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  35 
 
 
137 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  48.84 
 
 
140 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  44.3  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.11 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  38.89 
 
 
129 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  41.51 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  41.51 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  34.83 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  38 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  36.84 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  47.27 
 
 
134 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  47.73 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  34.25 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  46.15 
 
 
124 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  42 
 
 
180 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  34.25 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>