31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2016 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  100 
 
 
160 aa  323  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  47.83 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  47.17 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  25.66 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  48 
 
 
163 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  30 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  30 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  30 
 
 
177 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  48 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  46 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  46 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  41.82 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  41.82 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  41.51 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  44.23 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  41.82 
 
 
722 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  28.32 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  24.32 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  24.2 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  49.02 
 
 
185 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  48 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  39.58 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.25 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  25.17 
 
 
189 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  26.36 
 
 
156 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  34.92 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  28.91 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  24.81 
 
 
159 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  38.3 
 
 
145 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  25.34 
 
 
186 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>