51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5999 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  98.31 
 
 		 177 aa  357  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  83.62 
 
 		 177 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  83.62 
 
 		 177 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  83.62 
 
 		 177 aa  309  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  80.79 
 
 		 177 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  72.57 
 
 		 722 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  72.57 
 
 		 180 aa  276  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  72.57 
 
 		 180 aa  273  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  72.62 
 
 		 168 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  56.11 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  41.01 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  41.34 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  38.61 
 
 		 163 aa  91.3  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  39.08 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  35.54 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  44.78 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  36.27 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  46 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  35.87 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  45.76 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  37.34 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  43.64 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  45.1 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  43.64 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  34.78 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  43.64 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  42.25 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  39.19 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  36.49 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  43.4 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  41.82 
 
 		 147 aa  47.8  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  31.96 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  45.61 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  35.62 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  35.62 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  42.86 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  48.84 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  47.46 
 
 		 126 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  42.11 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  33.72 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  35.05 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  43.18 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  36 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  43.55 
 
 		 132 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  47.73 
 
 		 152 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  42 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  47.27 
 
 		 204 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  27.15 
 
 		 159 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  42 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  43.4 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>