101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2112 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  100 
 
 
137 aa  276  8e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1037  TadE family protein  46.09 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  33.33 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  39.66 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  33.33 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.58 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  36.08 
 
 
165 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  36.9 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  38.27 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  26.19 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  34.52 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  34.52 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  34.52 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  31.78 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  32.14 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  38.1 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  37.04 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  36.04 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4122  TadE family protein  36.56 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  27.74 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  40.38 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  28.24 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  29.76 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  27.78 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  29.31 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  41.38 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  30.63 
 
 
138 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  32.41 
 
 
128 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  42.03 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1737  TadE family protein  32.06 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  39.06 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  29.76 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  34.85 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  43.4 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  29.76 
 
 
153 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  33.33 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  30.47 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  35 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  34.17 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  29.41 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  38.46 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  32.5 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  31.72 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  36.05 
 
 
180 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  31.37 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  31.11 
 
 
176 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  31.96 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  31.96 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  29.66 
 
 
142 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  31.86 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  45 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  37.5 
 
 
148 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  37.04 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  31.4 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  31.4 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  36.67 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  33.72 
 
 
722 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  37.33 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  36.67 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  36.67 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  35 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  32.26 
 
 
176 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4453  TadE family protein  28.04 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  34.48 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  35.19 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  40 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2314  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  26.32 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  36.73 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  26.72 
 
 
140 aa  42.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  32.26 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  26.37 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  38.46 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  38.46 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  34.85 
 
 
336 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  30.53 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  29.79 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3347  TadE family protein  29.69 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  28.69 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3943  TadE family protein  34.21 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  28 
 
 
182 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  28.28 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  28.28 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  28.28 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  28.28 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1409  TadE family protein  27.41 
 
 
217 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.659631  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  32.79 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  33.94 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  30.58 
 
 
194 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  24.09 
 
 
132 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  28.67 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  28.67 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4160  TadE family protein  29.69 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  35.09 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  26.39 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  28.38 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  37.25 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  37.25 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  33.33 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  26.67 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>