84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2929 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  100 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  57.36 
 
 
124 aa  121  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  46.03 
 
 
126 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  41.86 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  37.3 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2921  TadE family protein  48.87 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.246386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  42.86 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  37.35 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  49.02 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  27.74 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  41.25 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  36.21 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  33.06 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  48.89 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  40 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  40 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  48.89 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  48.89 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  48.89 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  48.89 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  48.89 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  40 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  38.96 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  48.89 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  32.73 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  41.54 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  28.03 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  48.89 
 
 
140 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  46 
 
 
180 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  34.07 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  26.52 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  45.65 
 
 
156 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  26.52 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  48.89 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  26.52 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  29.6 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  34.15 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  36.56 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  33.33 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  43.1 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  38.89 
 
 
278 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  33.33 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  45.83 
 
 
180 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  39.58 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  38.89 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  37.04 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  37.04 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  37.04 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  32.53 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  31.34 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  46.81 
 
 
722 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  46.81 
 
 
168 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  37.93 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  45.65 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  39.29 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  28.93 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1911  TadE-like  26.76 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  41.67 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  28.85 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  29.67 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  46.81 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  30.6 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  44 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  40 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3347  TadE family protein  41.3 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  40 
 
 
168 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  27.94 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  41.67 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  33.33 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  29.66 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  26.87 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4160  TadE family protein  41.46 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  26.87 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  43.4 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  43.18 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  43.18 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  25.21 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4648  TadE family protein  39.22 
 
 
170 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.77371  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  30.38 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  32.81 
 
 
189 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  35.59 
 
 
134 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>