109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4440 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  100 
 
 
126 aa  254  4e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  51.16 
 
 
132 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  46.03 
 
 
129 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  52.46 
 
 
124 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  45.08 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  39.66 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  34.65 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  44.26 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2921  TadE family protein  48.41 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.246386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  50 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  34.78 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  33.33 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  40 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  50 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  36.94 
 
 
157 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  38.32 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  48.94 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  45.61 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  48.94 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  36.59 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  41.18 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  41.18 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  41.18 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  41.18 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  41.18 
 
 
155 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  37.38 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44.68 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  48.94 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  37.89 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.68 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  35.24 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.68 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3347  TadE family protein  35.64 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.68 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  37.36 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  37.04 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  34.52 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  50 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  35.24 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  35.16 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  37.74 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  37.36 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  29.77 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  36.26 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  36.26 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  36.26 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  38.54 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  50 
 
 
177 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  50 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  50 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  50 
 
 
177 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  43.64 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  47.06 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  47.06 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  35.37 
 
 
148 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  28.45 
 
 
135 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  33.96 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  31.62 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1037  TadE family protein  38 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  39.58 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.67 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  41.18 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  28 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  47.46 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  39.68 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  28.26 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  43.75 
 
 
180 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  46.67 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  47.46 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  30.65 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  35.58 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  31.78 
 
 
194 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  37.29 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  46.94 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  31.19 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  38.54 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  44.68 
 
 
180 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  44.68 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4160  TadE family protein  31.9 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  43.14 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  44.68 
 
 
722 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  40.82 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3423  TadE family protein  47.83 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  35.71 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  32.67 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4138  TadE family protein  43.75 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  33.85 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  43.4 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  40.43 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  33.85 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  29.27 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  45.65 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  33.85 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  33.85 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  33.85 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  33.85 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  48.98 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>