81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1164 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  34.33 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  37.93 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  34.75 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  35.62 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  34.53 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  35.65 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  30.65 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  35.29 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  30.43 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  29.92 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  32.88 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  28.24 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  50 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  27.86 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  27.12 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  27.12 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  42.86 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  42.86 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  42.25 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  42.25 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  34.67 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  29.77 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  27.93 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  37.88 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  39.62 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  38.16 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  38.16 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  38.16 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  23.93 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  23.93 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  23.93 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  23.93 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  38.16 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  27.2 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  36.36 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  23.93 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  23.93 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  44.64 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  37.88 
 
 		 722 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  42 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1910  TadE-like  36.99 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  27.78 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  37.5 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  38.18 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  38.18 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  38.18 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  35.09 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  35.09 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  40.82 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  37.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  22.69 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  40.82 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  40.82 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  40.82 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  24.53 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  40.91 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  35.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  35.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  28.92 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  35.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  38 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  35.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  35.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  35.09 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  41.18 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  38.78 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  34.55 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  38.78 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  32.76 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  38.78 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  38.78 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  29.7 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  38.78 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  38.78 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  33.93 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  40.43 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  33.33 
 
 		 209 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  38.33 
 
 		 167 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  35.29 
 
 		 154 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>