32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2369 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  47.83 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  29.81 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  41.96 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  36.53 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  59.18 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  44.78 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  44.78 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  30.73 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  48.15 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  48.15 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  48.15 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  49.06 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  43.94 
 
 		 722 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  45.31 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  44.44 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  47.46 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  31.87 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  32.87 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  43.1 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.25 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  30.43 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  27.14 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  25.9 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  27.68 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  41.3 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  38 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  25.69 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  42.86 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  38.46 
 
 		 204 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  32.69 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  25.21 
 
 		 129 aa  40.8  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>