46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2064 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  100 
 
 		 180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.23 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.23 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  56.25 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  56.25 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  56.25 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42.11 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  43.14 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  54.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  48.98 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  39.44 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  47.92 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  46 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44.68 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44.68 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  39.62 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  51.02 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  29.93 
 
 		 176 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0222  TadE family protein  27.47 
 
 		 124 aa  44.7  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  45.83 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  44 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  36.05 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  48.89 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  45.83 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  44 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  52.17 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  45.83 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  44 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  45.83 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  41.27 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  42.55 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  42 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  42 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  31.03 
 
 		 138 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 165 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  50 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  29.27 
 
 		 126 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  42 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  32.81 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  41.2  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  32.95 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>