51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5495 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  98.87 
 
 		 177 aa  360  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  93.79 
 
 		 177 aa  344  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  84.75 
 
 		 177 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  83.62 
 
 		 177 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  71.84 
 
 		 180 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  70.69 
 
 		 722 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  70.69 
 
 		 180 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  71.26 
 
 		 168 aa  259  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  55.03 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  40.45 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  41.9 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  42.77 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  42.57 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  34.34 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  48.15 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  30 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  36.54 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  28.76 
 
 		 148 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  35.42 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  35.95 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  46.15 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  46.15 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  46.15 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  43.64 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  28.87 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  42 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  44.07 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  50 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  38.16 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  40.74 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  43.4 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  36.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  35.14 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  41.51 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  45.45 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  44 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  31.82 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  44 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  46.51 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  37.04 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  38.6 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  34.25 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  34.25 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  42.11 
 
 		 147 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  31.46 
 
 		 159 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  36 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  47.73 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  44.23 
 
 		 124 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>