72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6780 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  89.8 
 
 		 147 aa  244  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  78.91 
 
 		 147 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  78.23 
 
 		 147 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  66.67 
 
 		 153 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  66.01 
 
 		 153 aa  180  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  65.36 
 
 		 153 aa  176  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  64.05 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  54.9 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  54.74 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  44.74 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  42.96 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  40.71 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  38.89 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  37.31 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  32.62 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  32.14 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  34.34 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  44.59 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  36 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  28.35 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  56.25 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  29.84 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  50.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  46.15 
 
 		 177 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  46.15 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  43.64 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  36.54 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  29.81 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  46.15 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  43.64 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  36.27 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  34.78 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  41.67 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  30.77 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  43.64 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  32.61 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  26.4 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  42 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  32.47 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  39.58 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2404  TadE family protein  30.19 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0489166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  37.7 
 
 		 162 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  39.34 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  42.11 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  42.19 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  40.82 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  35.29 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  29.46 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  29.5 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  27.72 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  36.21 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  37.17 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  37.17 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.77 
 
 		 156 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  34.55 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  42 
 
 		 156 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  39.29 
 
 		 152 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5124  TadE family protein  30.89 
 
 		 141 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0349202 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  38 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1037  TadE family protein  36.08 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  36.21 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  39.66 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  38.64 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  36.21 
 
 		 722 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  39.29 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  41.54 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  38.6 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  27.12 
 
 		 140 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>