107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1165 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  100 
 
 		 143 aa  293  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  39.87 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  33.09 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  47.46 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  39.04 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  34.38 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  36.52 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  30.91 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  38.73 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  30.91 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  42.47 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  33.64 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  58.33 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  34.51 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  50.91 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  46.67 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  31.91 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  50 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  40.7 
 
 		 722 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  49.02 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  49.02 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  39.77 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  39.77 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  38.67 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  31.86 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  40.96 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  39.06 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  47.06 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  57.63 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  45.83 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  47.17 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  44 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  39.19 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  39.19 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  53.45 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  42 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  42 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  42 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  52.27 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.9 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.9 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.9 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1260  TadE family protein  22.56 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.398874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  35.35 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  29.69 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  45.83 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  44.68 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  47.62 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20120  TadE-like protein  31.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0485019  normal  0.358256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  50 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  45.83 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  25.76 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  47.83 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  38.78 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  44 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  50 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  38 
 
 		 165 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  46.67 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  29.73 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  50 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  37.93 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  48.89 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2479  TadE family protein  26.32 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  48.89 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  34.26 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  29.13 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  41.3 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0801  TadE family protein  29.71 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  40 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4700  TadE family protein  30.49 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  48.89 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  39.29 
 
 		 147 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  42.62 
 
 		 156 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  40.43 
 
 		 189 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1342  TadE-like  36.67 
 
 		 175 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  48.89 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  48.89 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2327  TadE family protein  58.06 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.428289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  44.44 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  44.44 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 587 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4160  TadE family protein  26.27 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  31.62 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  34.38 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  47.46 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0794  hypothetical protein  40.28 
 
 		 484 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0581962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2686  hypothetical protein  40.91 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>