58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1314 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  304  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  98.69 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  97.39 
 
 
153 aa  268  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  92.16 
 
 
153 aa  255  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  61.87 
 
 
152 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  58.82 
 
 
147 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  64.05 
 
 
147 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  64.05 
 
 
147 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  64.05 
 
 
147 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  58.82 
 
 
147 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  55.32 
 
 
145 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  60.78 
 
 
147 aa  164  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  46.1 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  41.45 
 
 
148 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  43.48 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  41.91 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  34.78 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  33.8 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  33.54 
 
 
179 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  35.85 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  35.25 
 
 
136 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  29.76 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  43.14 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  44.64 
 
 
126 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  32.94 
 
 
135 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  30.15 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  44.07 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  37.93 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  34.15 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  33.33 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  28.95 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  35.62 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  35.62 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  32.48 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  37.5 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  29.73 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  45.83 
 
 
180 aa  43.9  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  44.64 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  31.88 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  39.58 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  34.25 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  34.25 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  34.25 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  43.4 
 
 
136 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  46.81 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  50 
 
 
163 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  41.54 
 
 
185 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  36.84 
 
 
151 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  34.25 
 
 
177 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  48.89 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  31.4 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  44 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  44 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  38.78 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  38.89 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  40.91 
 
 
180 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  31.13 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  30.59 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>