70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2368 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  60.26 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  37.4 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  35.9 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  36.42 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  37.91 
 
 		 145 aa  87  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  34.21 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  36.57 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  37.31 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  37.31 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  37.31 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  45.05 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  34.85 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  33.81 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  32.89 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  34.78 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  34.78 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  34.78 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  33.58 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  37.04 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  46.15 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  48.94 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  43.1 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  28.87 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  28.87 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  42.37 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  35.56 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  30.67 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  36.67 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  36.67 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  27.2 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  47.92 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  48.89 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  32.97 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  33.33 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  46.67 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  32.53 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  44.44 
 
 		 160 aa  43.9  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  47.83 
 
 		 189 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  30.71 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  27.12 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  35.59 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  47.73 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  40 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  36.92 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  28.69 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  36.92 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  47.73 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  41.51 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  47.73 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  36.92 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  36.92 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  36.92 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  36.92 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  47.73 
 
 		 180 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  27.87 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  39.29 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  41.67 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  42.86 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  47.73 
 
 		 168 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  32.05 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  38.6 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  29.01 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  43.14 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  43.75 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  28.87 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  35.09 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3494  TadE family protein  41.82 
 
 		 163 aa  40.4  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.0722743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  44.44 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>