41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2017 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  60.26 
 
 		 152 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  36.99 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  36.49 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  34.87 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  46.24 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  30.82 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  30.07 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  32.86 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  31.51 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  32.24 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  33.8 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  33.8 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  33.8 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  32.62 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  32.62 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  32.62 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  29.79 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  33.33 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  35.82 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  46.81 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  25.98 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  41.18 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0414  TadE family protein  33.72 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  43.14 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  34.69 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  38.89 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  34.69 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  35.05 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  34.38 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  30.23 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  26.58 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  33.33 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0612  TadE family protein  29.17 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  45.65 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  44.68 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  39.44 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  31.33 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  30.63 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  38.46 
 
 		 165 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  44.68 
 
 		 180 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>