41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4452 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  100 
 
 		 156 aa  323  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  39.62 
 
 		 171 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  32.1 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  50.67 
 
 		 168 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  34.01 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  31.65 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  31.65 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  64.15 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  64.15 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  64.15 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  58.73 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  60.71 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  60.71 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  60.71 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  60.71 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  60.71 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  60.71 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  34.87 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  46.48 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  30.5 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  32.64 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  38.82 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  44.23 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1665  TadE-like protein  34.04 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0478529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  38.98 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  30.71 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0840  TadE family protein  30.59 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  32.97 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  29.46 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  35.85 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  29.21 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  32.67 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  40.68 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  24.53 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  24.49 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  38.33 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  28.77 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  30.65 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  29.17 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>