9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2342 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  100 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  39.52 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  46.15 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  32.95 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2685  TadE family protein  40.91 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  27.83 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  37.66 
 
 		 179 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  42.31 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  37.74 
 
 		 209 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>