40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2685 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2685  TadE family protein  100 
 
 		 137 aa  273  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1523  hypothetical protein  61.19 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2342  TadE family protein  38.46 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  27.19 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  33.03 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2498  TadE-like  46.94 
 
 		 193 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0777596  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  30.53 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  28.24 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  34.03 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  33.8 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  35.09 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  32.26 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  30.14 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  29.2 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  35.71 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.5 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  23.08 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  35 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  34.48 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  28.57 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  42.55 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  37.5 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  37.5 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  42  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  37.1 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  37.5 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  40.38 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  40.38 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  33.33 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  35.44 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  34.38 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  26.96 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  35.48 
 
 		 147 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  43.14 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  43.14 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  43.14 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  35.59 
 
 		 174 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>