59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2707 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  324  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  100 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  44.44 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  44.97 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  44.97 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  44.97 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  44.97 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  44.97 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  44.97 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  43.62 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  42.24 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  40.91 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  40.26 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  40.26 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  39.87 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  34.62 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  38.85 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2065  TadE family protein  34.16 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261024  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  37.42 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  31.65 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2319  TadE family protein  35.62 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.208671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  29.8 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  52.54 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  32.68 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2154  TadE family protein  31.34 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168979  normal  0.0583008 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4356  TadE family protein  37.24 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4246  TadE family protein  37.24 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  29.25 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  27.21 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  30.41 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  27.85 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  25.64 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  50 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4374  hypothetical protein  26 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02595  hypothetical protein  35.16 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  28.86 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  45.83 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  28.95 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  27.86 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  32.76 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  33.8 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  43.75 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5822  TadE family protein  30 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.943338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  43.86 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  34.15 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  45.65 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  44.9 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  42.31 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  41.67 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  30 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  44 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  37.25 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55790  hypothetical protein  29.25 
 
 		 168 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  44 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  44 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  44 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4861  hypothetical protein  24.63 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  27.81 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  42.22 
 
 		 186 aa  40.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>