17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2734 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  100 
 
 		 145 aa  290  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1105  TadE family protein  63.11 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.142623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2367  hypothetical protein  60 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00108098  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  44.59 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  44.59 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  44.59 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  44.59 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  30.23 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  32.38 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  30.39 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  33.94 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  31.13 
 
 		 126 aa  40.8  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  30 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  34.85 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  38.3 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  34.85 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>