43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2452 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  278  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  93.66 
 
 
142 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  93.66 
 
 
142 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  93.66 
 
 
142 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  93.66 
 
 
142 aa  260  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  92.96 
 
 
142 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  92.96 
 
 
142 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  66.9 
 
 
142 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  66.9 
 
 
142 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  61.97 
 
 
142 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  51.88 
 
 
153 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  42.86 
 
 
157 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  40.74 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  35.37 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  34.51 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  36.44 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  31.86 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  41.3 
 
 
156 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31.09 
 
 
135 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  30.77 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  40 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  40 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  33.93 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  33.93 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  33.93 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  33.93 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  33.93 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  33.93 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  33.93 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  36 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  28.57 
 
 
151 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  27.12 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  22.69 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  31.19 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  29.23 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  25 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  37.5 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  33.33 
 
 
164 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  31.58 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  29.75 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  36.54 
 
 
209 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0801  TadE family protein  40.74 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  37.5 
 
 
156 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>